Crispr/Cas9 yoluyla Lsi-1 geni (Putative) susturulmuş domates (Solanum lycopersicum L.) bitkilerinde silikon alımının belirlenmesi

Abstract

Domates (Solanum lycopersicum L.), patatesten sonra Dünya'da en çok tüketilen ve gıda sanayii için çok önemli bir sebzedir. Tuzluluk ve kuraklık gibi abiyotik stresler, domatesin yaşam döngüsünü olumsuz yönde etkilemek suretiyle verim düşüşüne sebep olmaktadırlar. Abiyotik streslerin yol açtığı olumsuzlukların giderilmesinde silisyumun faydaları ve silisyum alım mekanizmaları çeltik, arpa, mısır ve bazı diğer bitkilerde yapılan çalışmalar ile aydınlatılmıştır. Ancak, literatürde domateste silisyum alım mekanizması ile sınırlı sayıda çalışma mevcuttur. Bu çalışmada, domateste silisyum alımından sorumlu genlerden biri olduğu in silico olarak gösterilmiş olan SlLsi1 geni CRISPR/Cas9 sistemi ile kesilmiştir. T1 bitkileri üzerinde yapılan sekans analizleri, CRISPR/Cas9 ile yapılan genetik modifikasyonun kalıtımsal olduğunu göstermiştir. SlLsi1 geninin domateste silisyum alımından sorumlu gen olduğunun fizyolojik ve transkriptomik analizlerle kanıtlanması planlanmış, ancak yüksek kimerizm oranına sahip, yetersiz sayıda T1 bitkisi elde edilmiştir.