Eggplant genome editing using crispr Cas9 technology

Abstract

Patlıcan (Solanum melongena L.,) birçok ülkede en önemli sebzelerden biridir. Uzun bir büyüme mevsimi vardır, bu da onu zararlılara, hastalık saldırılarına, çevresel strese ve parazit yabani otlara daha fazla maruz kalan sebzelerden biri yapmaktadır. Canavar otu olarak da bilinen Orobanche spp, patlıcan verim ve kalitesine büyük zarar verebilen parazit yabancı otlardan biridir. Bu parazitlerin tohumlarının çimlenebilmesi için konakçının köklerinden salgılanan strigolakton [SL'ler] adı verilen bazı kimyasallara maruz kalması gerektiği bilinmektedir. CCD8 geni, strigolaktonların sentezinde yer alan genlerden biridir büyüme ve gelişmenin kontrolünde önemli bir rol oynar. CRISPR-Cas9, patlıcandaki (Solanum melongena L) SmCCD8 genini manipüle etmek için kullanılmıştır. Çalışmanın amacı canavar otuna dayanıklı patlıcan hatları geliştirmektir. Bitki materyali olarak standart Yamula çeşidi kullanılmıştır. Agrobacterium aracılı bitki transformasyon yöntemi kullanılarak gRNA ve Cas9 patlıcana aktarıldı. Materyal olarak patlıcan kotiledonları kullanılmıştır. Patlıcan CCD8 genine ait hedef bölgenin başarılı bir şekilde düzenlendiği Sanger dizileme ile doğrulanmış. İndüklenen mutasyonlar, T1 ve T2 generasyonunda stabil bir şekilde aktarılmıştır. CRISPR-Cas9 teknolojisine genetik dayalı sonuçlarımız, parazitik yabani otlara dayanıklı patlıcan çeşitlerinin geliştirilmesinin yolunu açmıştırı.