Antalya ili patlıcan yetiştiriciliğinde sorun olan virüs hastalıklarının belirlenmesi ve en yaygın virüsün moleküler karakterizasyonu

Abstract

Türkiye'de patlıcan üretiminde lider olan Akdeniz bölgesinin Antalya ilinde patlıcan arazilerinde sorun olan virüs hastalıklarının tespiti ile ilgi bir araştırma yapılmamış olması sebebiyle bu tez çalışması yapılmıştır. 2016-2018 yılları arasında Antalya ilinin ilçelerinde sörveyler yapılmış, üretim miktarlarına göre örnekler toplanmıştır. Örnekler DAS-ELISA metoduyla Eggplant mottled dwarf virus (EMDV) ve Tomato spotted wilt virus (TSWV)'e; PCR metoduyla Tomato yellow leaf curl virus'e; RT-PCR metoduyla Alfalfa mosaic virus (AMV), Cucumber mosaic virus (CMV), Eggplant mosaic virus (EMV), Eggplant mottled crinkle virus (EMCV), Eggplant mottled dwarf virus (EMDV), Potato Y virus (PVY), Tomato bushy stunt virus (TBSV), Tobacco mosaic virus (TMV), Tomato mosaic virus (ToMV), Tomato chlorosis virus (ToCV) ve Tomato spotted wilt virus (TSWV)'e karşı testlenmiştir. Moleküler ve serolojik çalışmalar sonucunda AMV, EMV, EMCV, PVY, TBSV ve TMV ile enfekteli örnek bulunamazken, çalışma kapsamında toplanan örneklerin %10'u ToCV, %6'sı ToMV, %5'i EMDV, %4'ü TSWV ve %3'ü CMV ile enfekteli bulunmuştur. TYLCV %19 oranında bulunarak en yaygın virüs olarak belirlenmiştir. Bu sebeple TYLCV'nin ırkları moleküler olarak karakterize edilmiş ve biyoinformatik çalışmalarla desteklenmiştir. Tomato yellow leaf curl virus Mild ırkı % 40 ve Tomato yellow leaf curl virus Israil ırkı % 60 oranlarında tespit edilmiştir.